Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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ATRQ13535 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRQ13535 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRQ13535 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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