Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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