Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms