Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABPAQ06546 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABPAQ06546 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABPAQ06546 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABPAQ06546 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABPAQ06546 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABPAQ06546 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABPAQ06546 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABPAQ06546 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms