Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms