Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms