Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms