Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms