Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF3P18847 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF3P18847 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF3P18847 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF3P18847 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF3P18847 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF3P18847 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF3P18847 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms