Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX1O43812 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX1O43812 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX1O43812 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX1O43812 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX1O43812 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX1O43812 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX1O43812 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX1O43812 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX1O43812 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX1O43812 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX1O43812 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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