Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP17L13C9JLJ4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms