Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms