Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIFA1Q9NP55 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPIFA1Q9NP55 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms