Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms