Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM166A-201ENST00000344774 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092810.3-201ENST00000416349 473 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLCE1-AS2-204ENST00000438899 945 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC097375.1-201ENST00000507949 488 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 IMMP1L-209ENST00000532287 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABRB3-205ENST00000545868 1267 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01572-203ENST00000563823 563 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005379.1-201ENST00000585647 328 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZC3H14-203ENST00000318308 1384 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL023280.1-201ENST00000414840 1423 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MS4A4A-201ENST00000337908 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM48-201ENST00000265732 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms