Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC106Q9BWC9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms