Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms