Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNPPD1Q9BV87 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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