Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms