Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms