Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms