Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDK2Q58EX2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms