Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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VPS72Q15906 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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