Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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