Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms