Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBQ06643 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms