Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTG1P63261 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTG1P63261 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms