Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms