Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC13P31276 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms