Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms