Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms