Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms