Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms