Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms