Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF17Q5VTA0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms