Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms