Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms