Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RYR3Q15413 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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