Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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FAM27E3Q08E93 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FAM27E3Q08E93 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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