Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms