Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5AP29375 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5AP29375 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms