Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMLP26374 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMLP26374 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMLP26374 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms