Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf88P0DMB2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms