Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms