Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms