Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms