Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms