Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms