Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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