Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms